Ja, das muss man so unterscheiden. Allerdings muss man nicht GERADE JETZT aus Deutschland gekommen sein, sondern kann das auch schon vor 10, 20, 50 oder vor 100 Jahren. Somit deckt eine Aussage wie "viene de Alemania" häufig gleichzeitig beide Bedeutungen ab; genau wie im Deutschen auch:

viene de Alemania => er kommt aus Deutschland
es de Alemania => er ist aus Deutschland

venir => (her)kommen; venir de [...] = aus [...] hergekommen
ser de => sein aus; gebürtig aus